O Programa de Engenharia Nuclear conta com cinco laboratórios de pesquisa, como se pode ver abaixo:

	Laboratório de Métodos Numéricos (LMN)
	Laboratório de Instrumentação Nuclear (LIN)
	Laboratório de Monitoramento e Processamento (LMP)
	Laboratório de Simulação e Métodos em Engenharia (LASME)
	Laboratório de Neutrongrafia em Tempo Real (LNRTR)